המבנה הראשוני מתייחס לרצף החלבונים או למספר הליניארי ולסדרן של חומצות האמינו.
חלבונים הם מקרומולקולות ביולוגיות הנמצאות בכל האורגניזמים הביולוגיים, שהם פולימרים של חומצות אמינו המחוברות יחד על ידי קשרי פפטיד. הם מכילים אלמנטים כמו מימן, חנקן, חמצן, פחמן וגופרית היוצרים את החומר המבני של רקמות הגוף ומרכיבים עיקריים של שרירים, גידים, כלי דם, עצמות, שיניים, עור ושיער. מבני חלבונים הם הכרחיים לתפקודם של כל התאים והווירוסים החיים. כל סוג של חלבון שונה ברצף חומצות האמינו שלו. מיקומן של השרשראות הנבדלות מבחינה כימית מעניק לכל סוג חלבון תכונות אינדיבידואליות.
רמות מבנה החלבון הן מבנים ראשוניים, משניים, שלישוניים ורבעוניים.
המבנה הראשוני מתייחס לרצף החלבונים או למספר הליניארי ולסדרן של חומצות האמינו.
במבנה המשני, שרשראות חומצות האמינו מאורגנות במבנים רגילים הידועים גם בשם אלפא-סליקס ויריעות קפלים בבטא, המוחזקים יחד על ידי קשרי מימן.
המבנה השלישוני הוא הצורה התלת מימדית של מולקולת חלבון אחת המושפעת מקשר מימן, קישורי דיסולפיד, אינטראקציות אלקטרוסטטיות ואינטראקציה הידרופובית. המבנה מוחזק יחד על ידי אינטראקציות בין שרשראות הצד.
המבנה הרביעי אינו שונה מדי ממבנה שלישוני מבחינת אינטראקציה בין שרשרת. הוא מורכב משילוב של שתי רשתות או יותר להשלמת יחידה. קביעת המבנה הרביעי משתמשת בטכניקות ניסוי שונות הדורשות דגימות של חלבונים.
צור DNA הקיים באופן טבעי
רמות מבנה החלבון הן מבנים ראשוניים, משניים, שלישוניים ורבעוניים.
מבני החלבון יכולים להתפתח, כמו תחום חלבון, שיכול לתפקד ולהתקיים באופן עצמאי. רצפי DNA יכולים גם ליצור DNA קיים באופן טבעי כמו חלבונים רקומביננטיים. אלמנטים מסוג זה ועוד שומרים על מבני חלבון מורכבים.
עם התפתחות ההתפתחויות בביולוגיה המבנית, מדענים, חוקרים וסטודנטים ממשיכים ללמוד ולהבין את המורכבות של מבני חלבונים. כעת ניתן ללמוד חיזוי, הדמיה וניתוח של מבני החלבון באמצעות רצפי אנימציה. להלן מספר שלבים כיצד ליצור אנימציה של מבנה חלבונים:
הורד כלי המיועד להדמיה מונפשת, ניתוח ושרטוט מבנה חלבון וחיזוי חלבונים. ניתן לרכוש או להוריד מספר תוכניות אנימציה מולקולריות בחינם. יישומים שונים יכולים לספק אנימציות כדור ומקל של מבנים מולקולריים, אנימציה תלת-ממדית של מציאות מדומה, להציג סימולציות של דינמיקה מולקולרית, להראות סליל אלפא, פולימראז של DNA ו- DNA, קופסאות ביתיות, גיליון בטא וכו '. תוכנה כזו ארוזה בכלים לציור, צפייה, ומניפולציה במבנה בין משימות אחרות. דוגמאות לכך הן בנק הנתונים של חלבונים של Windows, Movie Mol, Dynamics Molecular Visual, Anthreprot, Storm, WinPep ו- Protein Advisor.
לאחר התקנת התוכנה, עקוב אחר ההדרכות לפני השימוש בכלי השירות. הכירו את התכונות הזמינות שיעזרו לכם לנווט בקלות. למשל, Protein Advisor, הזמין למחשבי מקינטוש, מאפשר ניווט מניפולציה קל בכל הערכים בבנק הנתונים של חלבון. הוא מספק הדמיה של מבנים ביו-מולקולריים באמצעות תצוגות אנימציה וסטריאו. יכולות צפייה מיוחדות מוצגות גם כן. זה גם מאפשר למשתמש למצוא את כל האטומים במרחק מוגדר וניתן לתפעל אותו באמצעות חלון הרישום. יכולות אחרות כוללות גרירת שאריות על גבי מבנה מבוסס רצף; השוואת מבנים תלת ממדיים, המאפשרת לחלץ תת-מבנים נפוצים של חלבונים; ציור מבנה תלת ממדי המאפשר לשרטט ולתייג שאריות על בסיסים ותרכובות, חיפוש קוד זיהוי של מבנים שצוינו וכו '.
חלבונים, שהם מרכיבים קריטיים של אורגניזמים ביולוגיים, מקלים על מרבית תפקודי החיים. חקר מבנה החלבון ותפקוד החלבון הוא חיוני ביותר לביוכימיה, כמו גם לתעשיות הביופיזיות, הביוטכנולוגיה והתרופות.
